通常而言，在展開潔凈廠房裝修改造的過程中，通常依據工作環節而將整個潔凈廠房劃分為若干區域，并且針對每一個區域配備相應的潔凈空調系統。采用此種方式，重點考慮的是技術夾層空間布置以及工序之間的差異化問題。

       相對而言，如果為整個車間布置一整套凈化空調，并且各個工序空間之間由回風管道連接，雖然在施工方面會更為方便，并且占地也相對嬌小，但是容易造成制冷不均勻局部氣流擾動過大的問題出現。并且一旦潔凈廠房啟用，潔凈空調必然會對整個潔凈區域展開工作，如果其中存在某一個工序環節閑置不用，空調也無法對該空間實現隔離，并且對于不同工序之間的環境控制效果也難以令人滿意。