生物安全實驗室空調凈化系統的劃分應該根據操作對象的危害程度、平面布置等情況經技術經濟比較后確定，并確定深圳廠房裝修步驟，應該采取有效措施避免污染和交叉污染。空調凈化系統的劃分應該有利于實驗室的消毒滅菌，自動控制系統的設置和節能運行。

生物安全實驗室空調凈化系統的設計應該充分考慮生物安全柜、離心機、二氧化碳培養箱、搖床、冰箱、高壓滅菌鍋、真空泵、緊急沖洗池等設備的冷、熱、濕和污染負荷。

生物安全實驗室送、排風系統的設計應該考慮所用生物安全柜、動物隔離器等設備的使用條件。生物安全實驗室選用優質的生物安全柜，動物隔離器不得向室內排風。

二級生物安全實驗室可以采用帶循環風的空調系統，如果涉及有毒、有害、揮發性溶液和化學致癌劑操作，則采用全新新風系統。二級生物安全實驗室也要采用全排風系統。

三級和四級生物安全實驗室的送、排風總管，四級生物安全實驗室主實驗室的送、排風支管均應該安裝氣密閥門。

三級和四級生物安全實驗室的污染區和半污染區內不應該安裝普通的風機盤管或房間空調器。

生物安全實驗室污染區宜臨近空調機房，使送、排風管道最短。